1 安装

1.1 安装R及Rsudio环境

先安装R及Rstudio, 前者是核心,后者是编辑器(写代码的地方)。

  1. 安装R,Win用户可点击R最新版下载,其他系统点击其它系统版本根据系统自行选择版本,如macbook, 请点击页面中的Download R for macOS。
  2. 安装时系统语言一定要选择英语,后续按默认即可。
  3. 安装RStudio Desktop,点击Rstudio Desktop下载对应系统版本的安装包。
  4. Win电脑可以考虑安装R版本对应的Rtools (可选项,新手可以不安装)。
  5. 重要提示:请卸载或者至少退出一切杀毒软件(微软自带的不用退出),否则安装包时可能会出现难以解决的奇怪bug。建议全部安装英语版本!

1.2 安装LZ包

  1. 安装LZ包所需的依赖包
# 设置镜像(可选)
options("repos" = c(CRAN = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")

if (!require("BiocManager", quietly = TRUE)) {
  install.packages("BiocManager") }
BiocManager::install() # BiocManager::install(version = "3.19")

# 安装依赖包(网络不好时需使用代理)
source("https://arronlz.github.io/LZ/install_package.R")
  1. 安装LZ, YZ包(后续更新只需要重新运行这句即可,上面的包不需要重新安装)
# 安装LZ包
devtools::install_github("ArronLZ/LZ", upgrade = "never", force = T)
# 安装YZ包
devtools::install_github("ArronLZ/YZ", upgrade ="never", force = T)