LZ Document
前言
为何阅读本书
1
安装
1.1
安装R及Rsudio环境
1.2
安装LZ包
2
RNAseq新版简化流程
3
RNAseq差异分析
3.1
差异分析
3.1.1
加载包
3.1.2
数据准备
3.1.3
文件夹准备
3.1.4
差异分析预设置
3.1.5
差异分析
3.2
火山图
3.3
热图
3.3.1
热图表格数据预处理
3.3.2
热图分组数据预处理
3.3.3
选定一种算法作图
3.3.4
循环各种聚类算法作图
3.4
富集分析
3.4.1
GO & KEGG 富集分析
3.4.2
GSEA分析
3.4.3
转录组其它可视化
4
RNAseq上游分析流程
5
ATAC分析流程
6
单细胞分析
7
空间转录组
References
编著：荔枝
LZ 文档
4
RNAseq上游分析流程
On the way …